Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrch1P62046 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms