Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms