Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tdrd6P61407 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tdrd6P61407 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tdrd6P61407 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tdrd6P61407 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tdrd6P61407 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tdrd6P61407 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tdrd6P61407 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tdrd6P61407 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tdrd6P61407 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tdrd6P61407 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd6P61407 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd6P61407 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tdrd6P61407 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms