Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg6P61406 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg6P61406 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smg6P61406 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smg6P61406 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg6P61406 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg6P61406 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms