Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tubgcp3P58854 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp3P58854 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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