Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpa1P57784 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms