Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms