Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PctpP53808 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PctpP53808 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PctpP53808 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PctpP53808 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PctpP53808 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms