Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClgnP52194 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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