Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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