Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TspoP50637 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
TspoP50637 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
TspoP50637 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms