Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FmodP50608 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
FmodP50608 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FmodP50608 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FmodP50608 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms