Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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