Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms