Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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