Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
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