Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf1P39428 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms