Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtlP38585 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TtlP38585 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtlP38585 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtlP38585 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtlP38585 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TtlP38585 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtlP38585 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtlP38585 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtlP38585 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtlP38585 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtlP38585 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtlP38585 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtlP38585 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtlP38585 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtlP38585 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtlP38585 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
TtlP38585 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtlP38585 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.8 ms