Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PpargP37238 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PpargP37238 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PpargP37238 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PpargP37238 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PpargP37238 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PpargP37238 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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PpargP37238 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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