Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab20P35295 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab20P35295 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab20P35295 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab20P35295 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms