Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms