Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NapbP28663 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NapbP28663 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NapbP28663 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NapbP28663 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NapbP28663 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NapbP28663 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NapbP28663 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NapbP28663 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NapbP28663 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NapbP28663 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NapbP28663 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NapbP28663 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NapbP28663 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NapbP28663 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NapbP28663 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms