Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Hoxd10P28359 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Hoxd10P28359 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Hoxd10P28359 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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