Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa5P28312 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms