Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2afxP27661 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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