Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms