Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NefhP19246 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NefhP19246 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NefhP19246 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NefhP19246 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NefhP19246 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NefhP19246 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NefhP19246 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NefhP19246 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NefhP19246 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NefhP19246 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NefhP19246 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NefhP19246 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NefhP19246 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NefhP19246 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NefhP19246 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NefhP19246 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NefhP19246 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NefhP19246 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms