Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18530 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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