Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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