Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P10404 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms