Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Becn2P0DM65 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Becn2P0DM65 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms