Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TtrP07309 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TtrP07309 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TtrP07309 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
TtrP07309 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
TtrP07309 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
TtrP07309 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
TtrP07309 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
TtrP07309 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TtrP07309 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TtrP07309 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TtrP07309 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TtrP07309 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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TtrP07309 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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TtrP07309 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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TtrP07309 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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TtrP07309 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TtrP07309 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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TtrP07309 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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TtrP07309 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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TtrP07309 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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TtrP07309 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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TtrP07309 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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TtrP07309 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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TtrP07309 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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