Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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H2-Eb1P04230 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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H2-Eb1P04230 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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H2-Eb1P04230 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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H2-Eb1P04230 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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H2-Eb1P04230 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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