Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01661 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01661 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01661 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01661 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01661 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01661 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01661 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01661 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01661 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01661 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01661 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01661 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01661 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01661 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01661 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01661 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01661 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01661 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P01661 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01661 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01661 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P01661 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms