Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01641 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
P01641 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P01641 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01641 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01641 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms