Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Ccl20O89093 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Ccl20O89093 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Ccl20O89093 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ccl20O89093 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ccl20O89093 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ccl20O89093 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ccl20O89093 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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