Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CopeO89079 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CopeO89079 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CopeO89079 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CopeO89079 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopeO89079 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms