Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Col5a1O88207 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Col5a1O88207 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Col5a1O88207 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Col5a1O88207 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Col5a1O88207 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Col5a1O88207 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Col5a1O88207 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Col5a1O88207 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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