Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms