Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Copb2O55029 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Copb2O55029 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copb2O55029 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Copb2O55029 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Copb2O55029 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Copb2O55029 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Copb2O55029 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Copb2O55029 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Copb2O55029 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copb2O55029 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copb2O55029 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copb2O55029 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copb2O55029 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms