Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2f6O54917 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2f6O54917 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f6O54917 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f6O54917 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms