Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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FxnO35943 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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FxnO35943 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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