Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms