Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc27a2O35488 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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