Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna3O35344 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms