Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ptpn9O35239 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ptpn9O35239 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ptpn9O35239 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ptpn9O35239 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ptpn9O35239 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ptpn9O35239 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ptpn9O35239 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ptpn9O35239 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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