Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnih2O35089 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms