Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LhbO09108 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LhbO09108 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LhbO09108 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LhbO09108 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LhbO09108 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LhbO09108 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LhbO09108 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LhbO09108 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LhbO09108 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LhbO09108 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LhbO09108 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LhbO09108 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LhbO09108 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LhbO09108 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LhbO09108 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms