Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms