Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MsmbO08540 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MsmbO08540 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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